Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Ccl20O89093 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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