Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms