Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Hoxd10P28359 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Hoxd10P28359 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms