Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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Ggta1P23336 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Ggta1P23336 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ggta1P23336 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ggta1P23336 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Ggta1P23336 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ggta1P23336 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ggta1P23336 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ggta1P23336 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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