Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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