Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3238W4VSP7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms