Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3550W4VSN7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3550W4VSN7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms