Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Csmd2V9GX34 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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