Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vstm4T1NXB5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vstm4T1NXB5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms