Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcniQ9Z2V9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcniQ9Z2V9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcniQ9Z2V9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcniQ9Z2V9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcniQ9Z2V9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcniQ9Z2V9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CcniQ9Z2V9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcniQ9Z2V9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CcniQ9Z2V9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CcniQ9Z2V9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcniQ9Z2V9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms