Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbd2Q9Z2E1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms