Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rlbp1Q9Z275 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rlbp1Q9Z275 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms