Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdf11Q9Z1W4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gdf11Q9Z1W4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf11Q9Z1W4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf11Q9Z1W4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf11Q9Z1W4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf11Q9Z1W4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf11Q9Z1W4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf11Q9Z1W4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf11Q9Z1W4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf11Q9Z1W4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf11Q9Z1W4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdf11Q9Z1W4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms