Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ddx39bQ9Z1N5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ddx39bQ9Z1N5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms