Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms