Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn15Q9Z0S5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn15Q9Z0S5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn15Q9Z0S5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms