Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L0

Tpbg, Trophoblast glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbgQ9Z0L0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpbgQ9Z0L0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TpbgQ9Z0L0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpbgQ9Z0L0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpbgQ9Z0L0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpbgQ9Z0L0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TpbgQ9Z0L0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms