Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn1Q9Z0I7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn1Q9Z0I7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms