Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbp2Q9Z0E6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms