Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AireQ9Z0E3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AireQ9Z0E3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms