Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nme4Q9WV84 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nme4Q9WV84 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms