Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VapaQ9WV55 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VapaQ9WV55 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms