Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lemd3Q9WU40 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lemd3Q9WU40 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms