Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sema6cQ9WTM3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6cQ9WTM3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms