Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lhx6Q9R1R0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx6Q9R1R0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms