Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psma1Q9R1P4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psma1Q9R1P4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms