Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tubd1Q9R1K7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms