Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Syt6Q9R0N8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syt6Q9R0N8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms