Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp2b2Q9R0K7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp2b2Q9R0K7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms