Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpc6Q9R087 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gpc6Q9R087 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gpc6Q9R087 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gpc6Q9R087 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gpc6Q9R087 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Gpc6Q9R087 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpc6Q9R087 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gpc6Q9R087 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gpc6Q9R087 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gpc6Q9R087 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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