Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsjQ9R014 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsjQ9R014 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsjQ9R014 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsjQ9R014 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtsjQ9R014 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtsjQ9R014 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms