Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ndrg3Q9QYF9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndrg3Q9QYF9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms