Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bcl11aQ9QYE3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bcl11aQ9QYE3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcl11aQ9QYE3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms