Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clca3a1Q9QX15 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clca3a1Q9QX15 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms