Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm4Q9JM83 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms