Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

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Length 1,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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Capn15Q9JLG8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Capn15Q9JLG8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Capn15Q9JLG8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Capn15Q9JLG8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Capn15Q9JLG8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Capn15Q9JLG8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Capn15Q9JLG8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Capn15Q9JLG8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn15Q9JLG8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms