Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nectin1Q9JKF6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nectin1Q9JKF6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms