Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scamp5Q9JKD3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms