Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nrip3Q9JJR9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nrip3Q9JJR9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms