Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1fQ9JIS7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1fQ9JIS7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1fQ9JIS7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1fQ9JIS7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1fQ9JIS7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1fQ9JIS7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1fQ9JIS7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1fQ9JIS7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms