Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnmb4Q9JIN6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kcnmb4Q9JIN6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms