Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim39Q9ESN2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim39Q9ESN2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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