Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OtofQ9ESF1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OtofQ9ESF1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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