Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc4Q9ES56 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc4Q9ES56 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms