Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Chrnb2Q9ERK7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrnb2Q9ERK7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrnb2Q9ERK7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrnb2Q9ERK7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrnb2Q9ERK7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrnb2Q9ERK7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrnb2Q9ERK7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrnb2Q9ERK7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrnb2Q9ERK7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Chrnb2Q9ERK7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.9 ms