Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clstn2Q9ER65 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms