Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms