Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Cxcr6Q9EQ16 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cxcr6Q9EQ16 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cxcr6Q9EQ16 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms