Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SgshQ9EQ08 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SgshQ9EQ08 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms