Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cpsf1Q9EPU4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpsf1Q9EPU4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms